Для поддержания в актуальном состоянии программ нужно проделать несколько несложных действий.
Обновляем порты, в FreeBSD 6.0 и выше, используем команды:
portsnap fetch – ## Если запускается впервые
portsnap extract – ## Распаковываем дерево портов
portsnap fetch update – ## При последующих обновлениях дерева портов
Для обновления установленного программного обеспечения можно использовать например portupgrade
для начала проверим что требуется обновить:
pkg_version -v | grep need
обновляем:
portupgrade название пакета - для обновления конкретного пакета
portupgrade -a - для обновления всех устаревших пакетов
UPD:
Для ежедневного обновления упакованного снэпшота и индексного файла при помощи portsnap и последующего отчета почтой об устаревших установленных пакетах добавьте в ваш файл /etc/crontab строку
0 3 * * * root portsnap -I cron update && pkg_version -vIL=
Подробности можно почитать тут